バイオ生産情報研究チーム

チームリーダーの紹介

写真チームリーダー:持田 恵一(理学博士)

学位

2003年3月
博士(理学)横浜市立大学院総合理学研究科

職歴

2003年4月
筑波大学 リサーチアソシエイト
2004年4月
長浜バイオ大学バイオサイエンス学部 生命情報科学コース 助手
2005年10月
理化学研究所植物科学研究センター リサーチアソシエイト(現特別研究員)
2008年4月
横浜市立大学院非常勤講師 兼任
2008年10月
理化学研究所植物科学研究センター 研究員
2010年7月~2013年3月
理化学研究所 社会知創成事業バイオマス工学研究プログラム バイオマス研究基盤チーム 上級研究員
2008年10月~2013年3月
理化学研究所植物科学研究センター 兼任
2013年4月~2015年3月
理化学研究所環境資源科学研究センターバイオマス工学連携部門 バイオマス研究基盤チーム 副チームリーダー
2013年4月~2015年3月
理化学研究所環境資源科学研究センター上級研究員 兼任
2015年4月~2018年3月
理化学研究所環境資源科学研究センターセルロース生産研究チーム チームリーダー
2018年4月~
理化学研究所環境資源科学研究センターバイオ生産情報研究チーム チームリーダー

主要論文

  1. Yusuke Kouzai, Minami Shimizu, Komaki Inoue, Yukiko Uehara-Yamaguchi, Kotaro Takahagi, Risa Nakayama, Takakazu Matsuura, Izumi C Mori, Takashi Hirayama,Sobhy  S H Abdelsalam, Yoshiteru Noutoshi, Keiichi Mochida.“BdWRKY38 is required for the incompatible interaction of Brachypodium distachyon with the necrotrophic fungus Rhizoctonia solani.”The Plant J. (2020)
  2. Keiichi Mochida, Alexander E Lipka, Takashi Hirayama.“Exploration of Life-Course Factors Influencing Phenotypic Outcomes in Crops.”Plant Cell Physiol 61,1381. (2020)
  3. Keiichi Mochida, Ryuei Nishii, Takashi Hirayama.Decoding Plant-Environment Interactions That Influence Crop Agronomic Traits.Plant Cell Physiol 61,1408. (2020)
  4. Toshihisa Nomura, Komaki Inoue, Yukiko Uehara-Yamaguchi, Koji Yamada, Osamu Iwata, Kengo Suzuki, Keiichi Mochida.“Highly efficient transgene-free targeted mutagenesis and single-stranded oligodeoxynucleotide-mediated precise knock-in in the industrial microalga Euglena gracilis using Cas9 ribonucleoproteins.”Plant Biotechnol.J 17,2032. (2019)
  5. Onda Y, Inoue K, Sawada Y, Shimizu M, Takahagi K, Uehara-Yamaguchi Y, Hirai MY, Garvin DF, Mochida K.“Genetic Variation for Seed Metabolite Levels in Brachypodium distachyon.”Int. J. Mol. Sci 20,9. (2019)
  6. Mochida K, Koda S, Inoue K, Hirayama T, Tanaka S, Nishii R, Melgani F.“Computer vision-based phenotyping for improvement of plant productivity: a machine learning perspective.”Gigascience 1;8(1). (2019)
  7. Mochida K, Koda S, Inoue K, Nishii R.“Statistical and Machine Learning Approaches to Predict Gene Regulatory Networks From Transcriptome Datasets.”Front Plant Sci 29;9:1770. (2018)
  8. Kouzai Y, Noutoshi Y, Inoue K, Shimizu M, Onda Y, Mochida K.“Benzothiadiazole, a plant defense inducer, negatively regulates sheath blight resistance in Brachypodium distachyon.”Sci Rep 26;8(1):17358. (2018)
  9. Takahagi K, Inoue K, Mochida K.“Gene Co-expression Network Analysis Suggests the Existence of Transcriptional Modules Containing a High Proportion of Transcriptionally Differentiated Homoeologs in Hexaploid Wheat.”Front Plant Sci 8;9:1163. (2018)
  10. Onda Y, Takahagi K, Shimizu M, Inoue K, Mochida K.“Multiplex PCR Targeted Amplicon Sequencing (MTA-Seq): Simple, Flexible, and Versatile SNP Genotyping by Highly Multiplexed PCR Amplicon Sequencing.”Front Plant Sci 23;9:201. (2018)