セルロース生産研究チーム

チームリーダーの紹介

写真チームリーダー:持田 恵一(理学博士)

学位

2003年3月
博士(理学)横浜市立大学院総合理学研究科

職歴

2003年4月
筑波大学 リサーチアソシエイト
2004年4月
長浜バイオ大学バイオサイエンス学部 生命情報科学コース 助手
2005年10月
理化学研究所植物科学研究センター リサーチアソシエイト(現特別研究員)
2008年4月
横浜市立大学院非常勤講師 兼任
2008年10月
理化学研究所植物科学研究センター 研究員
2010年7月~2013年3月
理化学研究所 社会知創成事業バイオマス工学研究プログラム バイオマス研究基盤チーム 上級研究員
2008年10月~2013年3月
理化学研究所植物科学研究センター 兼任
2013年4月~2015年3月
理化学研究所環境資源科学研究センターバイオマス工学連携部門 バイオマス研究基盤チーム 副チームリーダー
2013年4月~2015年3月
理化学研究所環境資源科学研究センター上級研究員 兼任
2015年4月~
理化学研究所環境資源科学研究センターセルロース生産研究チーム チームリーダー

主要論文

  1. Onda, Y., Mochida, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Seymour, R.S., Umekawa, Y., Pirintsos, S.A., Shinozaki, K., and Ito, K. "Transcriptome analysis of thermogenic Arum concinnatum reveals the molecular components of floral scent production." Sci Rep. Mar 4;5:8753 (2015).
  2. Miyazaki, Y., Maruyama, Y., Chiba, Y., Kobayashi, M.J., Joseph, B., Shimizu, K.K., Mochida, K., Hiura, T., Kon, H., and Satake, A. "Nitrogen as a key regulator of flowering in Fagus crenata: understanding the physiological mechanism of masting by gene expression analysis." Ecol Lett. Oct;17(10):1299-1309 (2014) .
  3. Mochida, K., Uehara-Yamaguchi, Y., Takahashi, F., Yoshida, T., Sakurai, T., and Shinozaki, K. "Large-Scale Collection and Analysis of Full-Length cDNAs from Brachypodium distachyon and Integration with Pooideae Sequence Resources. " PLoS One. Oct 9;8(10) (2013).
  4. Sakurai, T.+, Mochida K.+, Yoshida, T., Akiyama, K., Ishitani, M., Seki, M., and Shinozaki, K. "Genome-wide discovery and information resource development of DNA polymorphisms in cassava. " PLoS One. Sep 11;8(9):e74056. (2013). (+These authors equally contributed to this work)
  5. Yamazaki, M.+, Mochida, K.+, Asano, T., Nakabayashi, R., Chiba, M., Udomson, N., Yamazaki, Y., Goodenowe, D.B., Sankawa, U., Yoshida, T., Toyoda, A., Totoki, Y., Sakaki, Y., Góngora-Castillo, E., Buell, C.R., Sakurai, T., Saito, K. "Coupling deep transcriptome analysis with untargeted metabolic profiling in Ophiorrhiza pumila to further the understanding of the biosynthesis of the anti-cancer alkaloid camptothecin and anthraquinones. " Plant Cell Physiol. May;54(5):686-96(2013). (+These authors equally contributed to this work)
  6. Mochida, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Yamaguchi-Shinozaki, K., Shinozaki, K. and *Tran, L.S. "TreeTFDB: an integrative database of the transcription factors from six economically important tree crops for functional predictions and comparative and functional genomics. " DNA Res. 20,151-62(2013)
  7. Mochida, K., Uehara-Yamaguchi, Y., Yoshida, T., Sakurai, T. and Shinozaki, K. "Global landscape of a co-expressed gene network in barley and its application to gene discovery in Triticeae crops." Plant Cell Physiol, 52, 785-803 (2011).
  8. Mochida, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Yamaguchi-Shinozaki, K., Shinozaki, K. and Tran, L.S. "LegumeTFDB: an integrative database of Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula transcription factors. " Bioinformatics, 26, 290-291. (2010)
  9. Mochida, K., Yoshida, T., Sakurai, T., Ogihara, Y. and Shinozaki, K. "TriFLDB: a database of clustered full-length coding sequences from Triticeae with applications to comparative grass genomics. " Plant Physiol, 150, 1135-1146 (2009)
  10. Mochida, K., Saisho, D., Yoshida, T., Sakurai, T. and Shinozaki, K. "TriMEDB: a database to integrate transcribed markers and facilitate genetic studies of the tribe Triticeae. " BMC Plant Biol, 8, 72 (2008).